En ce qui me concerne, ça dépend aussi bien de la position main droite que de la position main gauche. Je fais ce qui me semble le plus pratique.
Pour étouffer le MI, souvent je le fais avec un doigt de la main droite, par exemple si je joue sur la corde de LA, il suffit d'appuyer un peu après avoir joué le LA et le MI ne résonne pas. C'est un peu nébuleux comme explication, j'vais essayer de faire mieux...
Parfois, j'utilise aussi le pouce de la main gauche, effectivement, par exemple sur "killing in the name" :
G|--------------- Dans ce cas, lorsque je joue le "3-4" sur la corde de RE, j'utilise le pouce MG pour
D|---------3-4--- étouffer le MI à vide précédent.
A|---3-5-------5-
E|-0-----0-------
Et la main gauche en général, que ce soit un doigt bien placé (rôôô, tout de suite
...), ou la paume de la main pour une corde plus aigue...
Bref ça dépend, mon conseil : ne vous limitez pas à UNE SEULE façon d'étouffer les cordes, faites au plus pratique