La basse est accordée en quartes en effet.
Un exemple simple :
Sur une gamme de La mineur toute simple, voici les différentes notes qui la composent :
La, Si, Do, Ré, Mi, Fa, Sol.
Ré est la 4e note ; c'est la quarte. La quinte ici, c'est Mi.
Maintenant regarde ta basse : Juste en dessous de la corde de La, il y a la corde de... ré !
C'était assez résumé, mais pour l'essentiel c'est ça.
Il faut penser "tonalement", pas "selon les cases". 5 cases, ça correspond à un écart de quarte, pas de quinte ! :-)