Toi tu vas bousiller tes baffles :)
Pour répondre précisément à ta question, il existe des pédales d'EQ pour basse, par exemple la GEB-7 de chez Boss. Il se pourrait qu'un bidule qui fasse de la simulation d'ampli ou multi-effets en même temps te convienne aussi pour cet usage (pour ne pas avoir le son "brut" de la basse, même après équalisation). Divers exemples : SansAmp Bass Driver DI, Line 6 Bass Pod, Korg Pandora PX4...
Perso j'utilise une petite table de mix (Soundcraft compact 4) dans laquelle je branche le PC, la basse, et tout le reste de mes trucs audio ; ou alors j'utilise l'entrée de ma boîte à rythmes, une Boss DR880, qui comprend tout ce qu'il faut (simulation d'ampli, multi-effets, accordeur... et boîte à rythmes, il va de soi).
Bref, les possibilités sont nombreuses... mais tu vas quand-même faire bien mal à tes baffles !